Ruben Abagyan, PhD

Logros Académicos Link to heading

Educación: Link to heading

  • M.S. en Biofísica Molecular y Química, S.c. laude (1980), Instituto de Física y Tecnología de Moscú
  • Ph.D. en Predicción de Estructura de Proteínas (1984), Universidad Estatal de Moscú

Cargos Académicos: Link to heading

  • Lieja, Bélgica: Científico visitante
  • EMBL, Heidelberg: Científico de plantilla
  • Universidad de Nueva York (NYU Medical School, The Courant Institute of Mathematics): Profesor asociado titular de Bioquímica y Matemáticas
  • The Scripps Research Institute, La Jolla: Profesor
  • Universidad de California, San Diego: Profesor

Premios y Honores: Link to heading

  • Dos premios CapCure por excelencia en investigación sobre cáncer de próstata (2000, 2002)
  • Premio y Medalla Princesa Diana, Sídney (2003)
  • Premio a la Excelencia del Personal y Profesorado de UCSD (2007)
  • Premio Docente del Año de AACP (2016)
  • Premio al Profesor del Año votado por los estudiantes de SSPPS (2018)
  • Índice H: 100
  • Reconocido dentro del 1% de los investigadores más influyentes y citados, Clarivate HCR (2018)

Experiencia en Liderazgo: Link to heading

  • Director de Biología Computacional e IT en el Instituto Skirball de Medicina Biomolecular, Nueva York (1994-1999)
  • Director en Novartis Institute, GNF (1999-2002)
  • Presidente de Descubrimiento de Fármacos Basado en Estructura, MipTec, Basilea, Suiza (2002-2009)
  • Fundador de MolSoft (1994)
  • Miembro del Consejo de Administración de Syrrx (2001-2002)
  • Miembro de la Junta Asesora Científica de Plexus Vaccines (2001-2003)

Comités Editoriales (Actuales): Link to heading

  • Endocrine DisruptorsAbout
  • American Journal of Pharmaceutical Toxicology
  • Cancer Genomics and Proteomics
  • IUPAC Glossary Committee
  • Journal of Computer-Aided Molecular Design

Membresías en Comités Directivos: Link to heading

  • Programa de Posgrado en Bioinformática y Biología de Sistemas, UCSD
  • Centro NCCR-Transcure de la NSF Suiza
  • Laboratorio Estatal Clave de Biología Química de Hong Kong

Membresías en Paneles de Revisión: Link to heading

  • Programa de Sinergia del Consejo Europeo de Investigación (2018, 2019, 2022, 2023, 2024)

Docencia: Link to heading

  • Química Farmacéutica II, Farmacología Física (SPPS 222)
  • Principios de Ciencias Farmacéuticas y Desarrollo de Fármacos (SPPS 263A)
  • Co-director del Seminario de Investigación en Bioinformática y Biología de Sistemas (BNF 199)

Contribuciones Claves: Link to heading

  1. Mecánica de Coordenadas Internas (ICM): formulación, algoritmos y código para muestreo estructural, dinámica, acoplamiento molecular, acoplamiento de péptidos y proteínas, y cribado de candidatos a fármacos.
  2. Muestreo conformacional global estocástico y búsqueda de mínimo de energía global para conjuntos multimoleculares en coordenadas internas con movimientos colectivos (fragmentos) y muestreo de raíz cuadrada.
    • Modelado guiado por ligandos de proteínas dinámicas grandes para predecir estados estructurales y funcionales alternativos.
  3. Definición y derivación del Pocketome: identificación de todos los bolsillos de unión a pequeñas moléculas con flexibilidad del receptor y múltiples ligandos para la caracterización de objetivos y predicción farmacológica de compuestos líderes y fármacos.
  4. Descubrimiento basado en estructura de candidatos a fármacos con propiedades multitarget o perfiles mejorados en oncología, enfermedades neurodegenerativas, enfermedades virales y parasitarias. Varios compuestos en ensayos clínicos.